معاونت بهداشت مسوول مدیریت برنامههای بهداشتی در مناطق تحت پوشش دانشگاه علوم پزشکی تهران است، این معاونت بر اساس شرح وظائف پیش بینی شده در سیستم بهداشتی (با مدیریت معاون بهداشت) در قالب 14 واحد ستادی به برنامهریزی ، آموزش، هدایت، نظارت، سازماندهی و ارزشیابی برنامهها در واحدهای ارائه دهنده خدمت میپردازد.
معاونت بهداشت دانشگاه، وظیفه اصلی خود را در قالب ایجاد پل ارتباطی میان جامعه و نیازهای بهداشتی از یک طرف و نقش آموزش مبتنی بر جامعه در دانشگاه از سوی دیگر و انجام پژوهشهای کاربردی به انجام میرساند .
مسئولیت ارائه خدمات سلامت سطح یک به گروه های مختلف سنی (کودکان 0تا 5 سال، نوجوانان 6 تا 18 سال، جوانان 18 تا 30 سال، میانسالان 30تا 60، سالمندان 60 به بالا ) در مناطق تحت پوشش دانشگاه، پیشگیری از بیماریها، شناسایی زودهنگام (غربالگری ) تشخیص و درمان، کاهش ابتلا به بیماری ها، ارتقای عادلانه سلامت در مناطق تحت پوشش، افزایش رضایتمندی گیرندگان خدمت و ارائه دهندگان خدمت، توانمند سازی افراد از طریق خودمراقبتی و ترویج شیوه زندگی سالم و بهبود کیفیت و سبک زندگی و افزایش امید به زندگی سالم از دیگر خدمات واحدهای تحت پوشش این معاونت می باشد که مردم محترم منطقه تحت پوشش با مراجعه به مراکز و پایگاههای سلامت می توانند با نوع خدمات و نحوه ارائه خدمات آشنا و از آن بهره مند شوند .
دسترسی کامل به خدمات بهداشتی در منطقه تحت پوشش از جمله اقدامات مهم این معاونت بوده است، امید آن می رود با فراگیر شدن این خدمات تمامی ابعاد سلامتی محقق شود .